Patrick Marguerat a étudié le hautbois successivement à Lausanne chez Markus Häberling, à Berne chez Hans Elhorst et à Genève chez Bernard Schenkel, où il obtient un 1er Prix de Virtuosité en 1989.
Il a également suivi des cours de perfectionnement auprès de Jost Michaels et de Maurice Bourgue, et a fait une formation postgrade sur le hautbois baroque dans la classe de Nils Ferber à Genève.
Depuis 1993, il fait partie de l’Orchestre de Chambre de Genève. En outre, il consacre une part importante de son activité à
l’enseignement de son instrument aux conservatoires de Sion et Lausanne.